在遥远的太空中，沉睡万年的巨兽加美拉因人类核试验而苏醒。它降落在东京，引发巨大恐慌。自卫队与科学家联手，试图找出对抗方法。加美拉并非普通怪兽，它拥有吸收能源并释放等离子火球的能力，更惊人的是，它似乎拥有智慧，避免伤及无辜。调查发现，加美拉是远古文明创造的生物兵器，使命是守护地球免受外星威胁。然而，它的觉醒也引来了真正的敌人——来自宇宙的侵略者。加美拉与人类从对抗转为合作，共同迎战外星入侵者。一场关乎地球命运的终极之战就此展开。
